系统树的构建及其在SARS病毒分类中的应用

作者：黄丽红; 荀鹏程; 赵杨; 陈峰

来源：中国卫生统计, 2006, 23(04): 315-318.

DOI：10.3969/j.issn.1002-3674.2006.04.008

• 系统树
• PHYLIP软件
• SARS病毒

目的探讨系统发育在SARS病毒分类中的应用。方法系统发育分析是通过构建系统树来评价物种或分子之间进化关系的一种方法。本文采用目前比较成熟、应用较为广泛的系统发育分析软件PHYLIP,根据GenBank中14个冠状病毒、17个SARS病毒和来自Flaviviridae和Togaviridae两个科的4个单链RNA病毒的完全基因组数据,选用UPGMA距离法构建系统树,构建SARS病毒分类。结果SARS病毒在冠状病毒中自身构成一个独立分支,与哺乳动物为宿主的冠状病毒的亲缘关系最近。结论系统发育树可以用于新型病毒的分类。

• 单位
  南通大学; 公共卫生学院; 南京医科大学