宁乡猪不同生长阶段结肠微生物菌群特征分析

作者：弯梦辽; 付鑫琳; 王芳; 尹业鑫; 谭名洋; 肖银涛; 陈家顺^*

来源：中国畜牧杂志, 2023, 59(11): 224-230.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20220917-02

• 宁乡猪
• 结肠
• 不同生长阶段
• 微生物多样性
• 16S rDNA测序

本研究以宁乡花猪为实验对象，旨在通过16S rDNA高通量测序技术探究5个不同生长阶段（30、70、150、200、250日龄）结肠微生物菌群的结构及特征差异，分析各个阶段微生物组成及多样性。结果显示：宁乡猪结肠微生物多样性只在30日龄与200日龄间差异显著，而微生物丰度30日龄与70～250日龄间差异显著、70～150日龄与200日龄间差异显著；通过菌群分类学分析发现，在不同生长阶段结肠微生物菌群分布于23个门（Phylum）、41个纲（Class）、85个目（Order）、141个科（Family）、294个属（Genus）；在门水平，厚壁菌门（Firmicutes）与拟杆菌门（Bacteroidota）为宁乡猪结肠微生物主要优势菌门，梭杆菌门（Fusobacteriota）与互养菌门（Synergistota）只存在于30日龄中；在属水平，乳酸杆菌属（Lactobacillus）、颤螺旋菌科（Oscillospiraceae＿UCG＿005）、普式菌属（Prevotella）、梭状芽孢杆菌属（Clostridium＿sensu＿stricto＿1）、链球菌属（Streptococcus）为优势菌属；不同时期的特异菌群存在显著差异。LEfSe方法分析发现不同生长阶段肠道特异菌群不同，但含有较多如乳杆菌属（Lactobacillus）、柯林斯菌属（Collinsella）等有益菌。随着宁乡猪的生长发育，其肠道中厚壁菌门（Firmicutes）相对丰度的增加和拟杆菌门（Bacteroidota）相对丰度的降低与脂肪沉积相关；变形菌门（Proteobacteria）与梭杆菌门（Fusobacteriota）相对丰度的降低与致病性相关；放线菌门（Actinobacteriota）相对丰度的增加与能量摄取和利用相关，说明宁乡猪肠道菌群结构随生长发育阶段的改变而发生相应变化。

• 单位
  湖南农业大学