Fkbp51基因敲除小鼠肝脏与大脑海马区RNA表达谱系的分析比较

作者：徐玉雪; 邱彬; 魏强; 雍伟东

来源：中国比较医学杂志, 2016, (05): 40-48.

• Fkbp51基因敲除小鼠
• 肝脏
• 神经系统
• RNA-seq Fkbp51 knockout mice
• Liver
• Nervous system
• RNA-seq

目的通过分析野生型小鼠(WT)与Fkbp51基因敲除(KO)小鼠肝脏、海马RNA表达谱系之间的差异,研究Fkbp51基因在代谢通路和神经通路中的作用。方法利用第二代测序技术对Fkbp51KO与WT小鼠的肝脏与海马mRNA进行表达谱测序,将测序结果用BRB-Array Tools进行分析,筛选出小鼠肝脏与海马的差异基因,然后分别利用在线工具DAVID对差异基因进行GO本体分析,STRING数据库对其进行蛋白质的相互作用网络分析,并利用Genecard对基因进行注释。结果 (1)Fkbp51的缺失,在肝脏中造成类固醇生物合成及代谢、脂类物质代谢以及氧化还原反应等相关基因表达水平的变化;(2)在海马...

• 单位
  中国医学科学院医学实验动物研究所; 国家中医药管理局; 中国医学科学院北京协和医院