基于全长转录组测序挖掘中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)性腺发育相关基因

作者：李鹏琛; 刘炳正; 苏唯一; 常帅; 金晗; 常亚青; 孙志惠^*

来源：基因组学与应用生物学, 2022, Z2: 2062-2075.

DOI：10.13417/j.gab.041.002062

• 中间球海胆
• 转录组测序
• 性腺发育
• 性别决定

中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)是一个重要的海水养殖品种，性腺是其唯一可食用的部分。海胆产业季节性强，若能人工控制其性成熟将具有重要的经济价值。本研究对处于营养噬细胞(nutritive phagocyte, NP)恢复期的中间球海胆精巢及卵巢进行全长转录组测序，以期挖掘参与其性别决定、性别分化和配子发生相关的基因。通过从头组装(de novo)获得64 949条Unigenes,通过同源比对分析共注释了23 848个(36.72%)功能基因。通过比较精巢及卵巢中Unigenes的表达水平，获得了15 985个差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)。与精巢相比，卵巢中8 355个DEGs显著上调，7 630个DEGs显著下调。利用GO聚类分析、差异基因表达分析等鉴定了14个精巢特异表达基因(DMRT1、Catspere、Meioc等), 16个卵巢特异表达基因(TGFBI、EGF3、EGF1等)和19个进化上保守的性别相关基因(Spata4、DMC1、HSF5、gata4等)。本研究为解析中间球海胆性腺发育机制奠定了基础。

• 单位
  大连海洋大学