党的十九大报告明确指出,要建立以企业为主体、市场为导向、产学研深度融合的技术创新体系,进一步把科技创新和成果转化作为实现建设现代化经济体系战略目标的战略支撑。本文从企业科研绩效审计的目标、特点出发,对绩效审计存在的难点进行分析,构建一套评价科研绩效的指标体系,综合运用多样化审计方法对科技投入、科技创新、成果应用的创新性、效率性、效果性进行评价,为科研绩效审计提出一套切实可行的研究方法。