基于SSR分子标记的灯盏花遗传多样性分析

作者：田星; 李中霁; 刘小莉; 李国栋

来源：中国实验方剂学杂志, 2021, 27(18): 136-143.

DOI：10.13422/j.cnki.syfjx.20211119

• 灯盏花
• 简单重复序列(SSR)分子标记
• 遗传多样性
• 遗传结构
• 主坐标分析
• 聚类分析

目的:研究灯盏花Erigeron breviscapus居群遗传多样性,为灯盏花资源的合理利用与保护提供科学依据。方法:采用12对简单重复序列（SSR）分子标记对灯盏花16个野生居群共243个样品进行遗传多样性研究,计算遗传多样性参数,并进行主坐标分析和结构聚类分析。结果:共检测到209个等位基因,平均每个位点的等位基因数为17.417个;基于12对SSR引物和16个灯盏花居群,观测杂合度（H0）分别为0.603,0.613,期望杂合度（He）分别为0.658,0.659,香浓（Shannon）信息指数（I）分别为1.443,1.446,遗传分化系数(Fst)0.123,基因流（Nm）2.077;分子方差分析（AMOVA）与遗传分化分析结果显示主要变异来源于居群内个体间变异;居群间遗传距离和遗传一致度分别为0.107（YA和XY）～0.713（SZ和XZD）,0.490（SZ和XZD）～0.899（YA和XY）;主坐标分析和结构聚类分析分别将16个居群分为2组。结论:SSR分子标记结果显示,灯盏花居群遗传多样性较高,居群内和居群间具有一定的遗传分化和Nm;遗传变异主要存在于居群内个体间。该实验结果可为灯盏花后续的优良种质选育等研究提供参考依据。

• 单位
  云南中医药大学