本发明公开了一种异硬脂醇异硬脂酸酯的制备方法。本发明的异硬脂醇异硬脂酸酯的制备方法,包括以下步骤:1)将异硬脂醇、异硬脂酸、催化剂和携水剂混合,进行酯化反应,得到含酯的反应液;2)将酯从含酯的反应液中萃取出来,再经减压蒸馏,得到粗产品;3)将粗产品进行分子蒸馏,得到异硬脂醇异硬脂酸酯产品。本发明的异硬脂醇异硬脂酸酯产品纯度高,酸值低于1mgKOH/g,羟值低于5mgKOH/g,色度低于70Hazen,无异味、刺激性低,且制备工艺简单、高效、环保,适合大规模生产与应用。