血吸虫丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶RIO2的生物学信息预测

作者：赵珍; 阿孜尔古丽·阿布都克日木; 屈艳琳; 戴军; 丁剑冰; 于涛^*

来源：寄生虫病与感染性疾病, 2018, 16(04): 182-191.

• 日本血吸虫
• RIO2蛋白
• 抗原表位
• 生物信息学

目的应用在线软件分析血吸虫丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶RIO2抗原蛋白的生物学信息,为研制新型血吸虫病基因疫苗提供理论基础。方法采用蛋白质分析系统Protparam (http:∥expasy. org/tools/protparam. html)分析血吸虫丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶RIO2蛋白的理化性质;利用软件Protscale (http:∥www. espasy. org/cgibin/protscale. p1)蛋白质在线分析RIO2蛋白的亲(疏)水性;在线软件预测血吸虫RIO2丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶蛋白的二级结构,利用Py MOL viewer软件作图构建三级结构模型。结果利用在线软件预测血吸虫RIO2抗原蛋白的二级结构中α螺旋结构占41. 01%,β-折叠占11. 63%,无规则卷曲占34. 25%。负电荷残基(Asp+Glu)数为55,正电荷残基(Arg+Lys)数为77,不稳定系数为50. 41,预测为不稳定蛋白;总平均亲水性系数为-0. 633,可能为亲水性蛋白质;预测RIO2蛋白糖基化位点在31、96、176、260、330和369氨基酸处,且存在在1个丝氨酸、1个苏氨酸、2个酪氨酸磷酸化。结论生物信息学分析血吸虫RIO2含有磷酸化位点和糖基化位点。因此推测其可能具有免疫原性,可为血吸虫高效表位疫苗的研发提供参考,为血吸虫病的临床诊断与治疗提供新的靶标。

• 单位
  新疆医科大学; 山东省济宁市第一人民医院; 济宁医学院; 基础医学院; 山东省寄生虫病防治研究所