构建内外部环境匹配的组织结构,是新时代高校有效推进"双一流"建设、"新工科"发展、地方本科院校转型、双创教育等的举措。应用型大学的组织结构应该实现学术权力与行政权力的平衡、适应敏捷人才培养的学科专业建设范式、满足应用型大学发展的资源配置模式。社会需求、政策与实践为地方院校组织结构重构提供了可能。地方院校转型发展的组织重构重点应该是重构以学科为核心的学科学院、以专业为支撑的产业学院和以学生工作为本、学生宿舍为载体的书院等组织,并研究这些组织重构后的运行机理。