代谢网络是体现细胞生理特性的一整套生物化学反应的集合，是生物网络的一个重要组成。其节点代表代谢物，而边则对应着生化反应及其酶。代谢网络的研究手段中网络比对是非常重要的一个方向，其目的是区分代谢网络的异同，从而发现不同子代谢网络的拓扑和/或功能成分之间的相似网络。由于组学检测技术和大数据分析的发展，近年积累了大量代谢网络，推动了代谢网络比对的迅速发展。文章对代谢网络比对以及更广泛的生物网络比对方法进行了阐述。
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