芜菁花叶病毒吉林分离物外壳蛋白基因克隆与序列分析

作者：王凤婷; 李琳; 孙玥; 祝富祥; 乔凯彬; 张祥辉; 潘洪玉; 刘金亮^*

来源：东北农业科学, 2023, 48(05): 71-75.

DOI：10.16423/j.cnki.1003-8701.2023.05.015

• 吉林省
• 芜菁花叶病毒
• cp基因
• 系统进化
• 序列分析

为明确芜菁花叶病毒（Turnip mosaic virus, TuMV）在吉林省十字花科蔬菜上的侵染情况，用RT-PCR方法扩增获得吉林省16个TuMV病毒分离物的cp基因，并对其序列进行分析。结果表明，本研究所获得的16个吉林省TuMV分离物和2个山东省分离物cp基因序列同源性为90.3%～100%，与其他30个从GenBank上获得的TuMV分离物核苷酸同源性为81.9%～99.3%。TuMVcp基因系统进化分析显示:48个TuMV分离物分布在5个组，吉林省TuMV分离物存在basal-B组和word-B组2个株系，basal-BR组为优势株系，在Asian-BR、basal-B和OMS组中均无分布。重组分析表明，吉林省16个TuMV病毒分离物cp基因都未发生重组事件。选择压力分析显示cp基因编码区处于负向或纯化选择压力。

• 单位
  吉林大学