砂藓(Racomitrium canescens)RcADH基因的克隆及生物信息学分析

作者：沙伟; 孙玉斌; 马天意^*; 张梅娟

来源：基因组学与应用生物学, 2021, Z1: 2270-2275.

DOI：10.13417/j.gab.040.002270

• 砂藓
• 乙醇脱氢酶
• 基因克隆
• 生物信息学分析

本研究以砂藓(Racomitrium canescens)为材料,克隆得到砂藓乙醇脱氢酶基因RcADH。在拟南芥(Arabidopsis thaliana)中构建了RcADH过表达株系。通过对其生物信息学分析显示:RcADH的cDNA开放阅读框长1 140 bp,编码含有379个氨基酸残基的多肽序列。RcADH蛋白理论等电点为6.79;脂肪指数为89.0,不稳定系数为24.35,属于不稳定的蛋白质。分析蛋白的跨膜结构域,结果显示RcADH基因编码的蛋白不含跨膜区。预测RcADH蛋白质中没有信号肽,属于非分泌型蛋白质。砂藓中RcADH蛋白与其它植物中的乙醇脱氢酶蛋白质序列具有较高的相似性,蛋白质亲缘关系系数为96.83%。本研究可为进一步探索RcADH基因功能提供基础。

• 单位
  齐齐哈尔大学