申克孢子丝菌4Hppd基因结构功能的生物信息学分析

作者：吴晓雁; 张静; 黄家敏; 孙瑶; 黄晓雯; 高文超; 吴榕; 陈三妹; 黄怀球^*

来源：皮肤性病诊疗学杂志, 2020, 27(02): 79-88.

DOI：10.3969/j.issn.1674-8468.2020.02.003

• 申克孢子丝菌
• 对羟苯基丙酮酸双加氧酶基因
• 生物信息学分析

目的:初步预测及分析申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii,Ss.)对羟苯基丙酮酸双加氧酶基因(4Hppd)编码蛋白的结构和生物学功能特征。方法:应用生物信息学在线工具预测分析Ss. 4Hppd编码蛋白的理化性质及功能特征。结果:Ss. 4Hppd基因编码蛋白含对羟苯基丙酮酸双加氧酶保守域,由477个氨基酸构成,理论分子量为52. 0 k D,等电点为5. 98,半衰期较长,该蛋白为非分泌蛋白,定位于线粒体中。其二级结构以无规则卷曲及α-螺旋为主,另外还存在乙二醛酶功能域及丰富的磷酸化位点,与其他致病真菌同源蛋白有较高的相似度。结论:预测Ss. 4HppD位于线粒体中,具有乙二醛酶功能域结构功能特点及丰富修饰位点,可为其表达、晶体结构分析及小分子抑制剂开发提供参考。

• 单位
  南方医科大学南方医院; 深圳市人民医院; 中山大学附属第三医院; 中山大学孙逸仙纪念医院; 安徽医科大学第一附属医院