基于线粒体COⅠ基因的9个青鱼群体遗传变异分析

作者：鲍生成; 包天杰; 王沈同; 徐晓雁; 代雅凡; 张家华; 李家乐; 沈玉帮^*

来源：水生生物学报, 2022, 46(07): 933-938.

• COⅠ基因
• 地理群体
• 遗传多样性
• 遗传分化
• 青鱼

为掌握中国青鱼(Mylopharyngodon piceus)种质资源分布特征,揭示青鱼种质资源的遗传变异情况,研究通过对9个青鱼群体271个样本线粒体COⅠ区设计引物并进行PCR扩增,运用软件分析了群体内部遗传多样性和各群体之间的进化关系。分析结果表明:长度为1003 bp的9个群体COⅠ基因区域序列GC含量低于AT含量,共检测到6个突变位点, 7种单倍型,其中Hap4单倍型在9个群体中都有分布。AMOVA分子方差分析显示271个青鱼样本的变异90.33%来自群体内部, 9.67%来自群体间。青鱼总体核苷酸多样性(π)偏低,在0.00109—0.00244。单倍型多样(Hd)性较高,在0.403—0.847。遗传分化系数(Fst)在–0.0033—0.23445,保持在低度至高度分化,主要集中在低度和中度分化。分析得到广东佛山群体可能经历过瓶颈效应,其余8个群体可能经历过快速的种群扩张事件。研究结果揭示了中国目前青鱼种质资源的遗传背景,可以为中国青鱼种质资源的保护和创新利用提供重要的参考依据。

• 单位
  上海海洋大学