水稻柱头外露率主效QTL qTSE4的定位

作者:何晓娟; 万华; 高俊文; 顾伟航; 谢振威; 赵志刚; 万建民
来源:南京农业大学学报, 2022, 1-10.

摘要

[目的] 柱头外露率是杂交水稻制种中的一个重要指标,本研究旨在检测控制水稻柱头外露率QTL及精细定位相关基因。[方法] 以低柱头外露率粳稻品种‘02428’和高柱头外露率亲本ZH464配组的F_(2)群体进行QTL位点检测,在目标区域内利用分子标记筛选杂合单株连续自交获得F_(2:3)和F_(3:4)群体进行多年稳定QTL位点定位,同时利用BSA-seq技术对F_(3:4)群体进行了柱头外露率QTL定位和候选基因序列分析。[结果] 相关性分析结果显示单柱头外露率、双柱头外露率和总柱头外露率这3个性状存在极显著的相关。本研究以总柱头外露率作为表型数据,利用已构建的覆盖全基因组分子连锁遗传图谱进行QTL定位,检测到第2和4染色体上两个位点:qTSE2和qTSE4,选择贡献率大的qTSE4位点进行后续研究,该位点在F_(2:3)和F_(3:4)群体中重复检测到。结合BSA-seq测序结果,在qTSE4位点区间内筛选到两个存在差异的基因。[结论] qTSE4位点作为柱头外露相关的主效QTL位点,可进行后续的精细定位,筛选到的两个候选基因有待进一步转基因功能验证。