部分春大豆主栽品种叶绿素含量全基因组关联分析

作者:张大勇; 王象然; 吴雨恒; 赫晨宇; 杨柳; 贾璐; 庄静而
来源:东北农业大学学报, 2022, 53(12): 1-9.
DOI:10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2022.12.001

摘要

叶绿素是植物光合作用主要色素,对大豆产量形成具有重要影响。利用196份已重测序的国内外品种构成自然群体为试验材料,测定该群体苗期叶绿素含量,结合混合线性模型(Mixed linear model)进行全基因组关联分析。结果表明,根据阈值筛选得到37个显著相关SNP位点,分别位于第2、3、4、7、10、13、16号染色体上,在SNP位点上下游各100 kb搜索到194个相关基因。通过GO功能富集分析、KEGG代谢通路富集分析及基因功能注释,筛选得到11个可能与叶绿素含量相关的候选基因,通过相对表达量分析鉴定得到4个Glyma.02G185300、Glyma.03G085000、Glyma.10G259900、Glyma.16G037100与大豆叶绿素含量相关基因。研究结果为探究大豆叶绿素含量遗传机理提供理论参考。

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