摘要
目的 探索结核通路相关基因表达差异与肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma, LUSC)预后及肿瘤免疫微环境的关系,判别结核合并LUSC的预测基因和免疫因子,寻找新的治疗靶点。方法 基于京都基因与基因组百科全书数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)获取结核相关通路(map05152)基因。利用癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas, TCGA),纳入374例LUSC患者的基因表达谱,并进行归一化处理。构建COX比例风险回归模型并通过受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线进行验证,利用列线图分析LUSC患者的预后,并分析结核通路基因在不同风险分组的肿瘤微环境和单样本免疫浸润富集差异。结果CASP9、FADD、PLK3基因与LUSC预后相关。风险评分高的患者更容易出现免疫细胞浸润富集差异,尤其是central memory CD4 T、effector memeory CD4 T、gamma delta T、natural killer和natural killer T等免疫细胞呈低富集状态。结论 CASP9、FADD、PLK3基因可用于评估LUSC患者的预后,并根据风险评分识别肿瘤免疫微环境的变化。对于高风险组有富集差异的免疫细胞,未来有望进一步研究并发现结核合并LUSC潜在的治疗靶点。
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单位广西医科大学; 生命科学研究院