人头颈鳞癌中ceRNA网络构建及表达趋势

作者：张岚; 刘法昱^*

来源：解剖科学进展, 2020, 26(02): 143-149.

DOI：10.16695/j.cnki.1006-2947.2020.02.006

• 乳颈部鳞癌
• 生物信息学分析
• ceRNA

目的分别比较4例HNSCC患者癌和癌旁组织的环状RNA、微小RNA和mRNA芯片表达谱,构建hsacircRNA103580/hsa-miR-9-5P/PRDM15相关的ceRNA网络,探讨其表达趋势。方法利用芯片筛选HNSCC组织中差异表达的circRNA、miRNA和mRNA基因,根据miRwalk3.0在线软件预测的结果,构建HNSCC中的circRNA/miRNA/mRNA-相关的ceRNA网络。采用qRT-PCR方法检测HNSCC组织中hsacircRNA103580/hsamiR-9-5P/PRDM15基因的表达。结果芯片技术检测4例HNSCC患者癌和癌旁组织中差异表达的circRNA、miRNA及mRNA基因,获得显著差异的环状RNAs转录本311个,microRNAs转录本52个及circRNA433个。结合以上数据,构建了一个包含48种circRNAs,21种miRNAs和79种mRNAs的ceRNA网络并验证has-circRNA103580、has-miR-9-5p与PRDM15的基因表达水平与芯片中表达趋势一致。结论 hsacircRNA103580/hsa-miR-9-5P/PRDM15轴可能是HNSCC预后和治疗新的靶点。

• 单位
  中国医科大学附属口腔医院