基于病毒宏基因组纳帕海高原湿地病毒种群结构研究

作者：徐志伟; 陈学梅; 魏云林; 张琦; 季秀玲^*

来源：基因组学与应用生物学, 2022, 41(02): 305-314.

DOI：10.13417/j.gab.041.000305

• 纳帕海高原湿地
• 病毒群落
• 功能基因
• 病毒宏基因组

病毒广泛分布于自然环境中，随着高通量测序技术的快速发展，对病毒遗传多样性研究也越来越多，但是高原湿地病毒研究相对较少。本文利用病毒宏基因组学方法开展纳帕海高原湿地病毒种群结构和遗传多样性的研究，发现纳帕海高原湿地中DNA病毒占99.4%,RNA病毒占0.6%;DNA病毒中噬菌体占47.95%。病毒科水平注释结果表明，长尾病毒科(Siphoviridae)、肌病毒科(Myoviridae)、类双生病毒科(Genomoviridae)、疱疹病毒科(Herpesviridae)、藻类DNA病毒科(Phycodnaviridae)和拟菌病毒科(Mimiviridae)等为优势病毒，这些病毒丰度与总氮、叶绿素a、锌等环境因子相关，优势病毒在地理位置上的分布具有显著差异。藻类病毒系统发育分析表明，纳帕海高原湿地中包含目前已知的6种藻类DNA病毒属。开展纳帕海高原湿地病毒种群丰度、基因组功能解析、分布差异和环境因子相关性研究，为了解纳帕海病毒种群结构特点，进一步阐明病毒在湿地生态系统中的功能提供科学依据。

• 单位
  昆明理工大学