胃癌肿瘤突变负荷miRNA预测模型的构建和验证

作者：陈融; 李伟娜; 姜相君^*

来源：胃肠病学, 2022, 27(04): 232-238.

• 胃肿瘤
• 免疫检查点抑制剂
• 微RNAs
• 肿瘤突变负荷

背景：肿瘤突变负荷（TMB）是一个很有前途的预测因子，可在一定程度上预测肿瘤患者应用免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的效果。微RNA(miRNA)作为在抗癌免疫反应中的关键调节因子，与胃癌患者TMB之间的关系尚不明确。目的：通过分析TCGA数据库中胃癌患者测序数据和临床数据，构建胃癌患者TMB预测模型并加以验证。方法：将TCGA数据库中的胃癌患者分为高TMB组和低TMB组，筛选差异表达miRNA。将胃癌患者随机分为训练组和验证组，对训练组数据采用lasso回归分析法构建预测TMB水平的miRNA预测模型，并使用验证组数据进行验证。对筛选出的相关miRNA进行KEGG功能富集分析，并分析与3个ICI的相关性。结果：共筛选出54个差异表达miRNA，其中20个为TMB相关miRNA。MiRNA预测模型的敏感性、特异性、AUC均较高。功能富集结果表明，TMB相关的miRNA主要参与与免疫反应相关的生物学过程以及与癌症相关的信号通路。MiRNA预测模型与PD-L1(r=0.36,P<0.01)中度正相关，与PD-1(r=-0.31,P<0.01)中度负相关，与CTLA4无明显相关性（r=0.14,P<0.01）。结论：本研究构建了一种miRNA预测模型，可对不同TMB水平的胃癌患者进行分层。

• 单位
  青岛大学; 青岛市市立医院