紫芝栽培新品种武芝2号基于rDNA-ITS和ITS2的分子鉴定与分析

作者：钟礼义; 应正河; 刘新锐; 陈体强^*

来源：广东农业科学, 2022, 49(02): 9-15.

DOI：10.16768/j.issn.1004-874X.2022.02.002

• 紫芝
• 武芝2号
• 紫芝S2
• rDNA
• ITS/ITS2
• 序列分析

【目的】探讨利用rDNA-ITS及其ITS2二级结构进行紫芝栽培新品种武芝2号（原名紫芝S2）的分子鉴定。【方法】通过第一代和第三代测序技术分别获得武芝2号的ITS序列，针对灵芝属（Ganoderma spp.）相关种类的ITS序列构建系统进化树进行分子分类鉴定，采用rDNA-ITS及相关引物序列进行BLAST比对分析，在线预测ITS2二级结构。【结果】Sanger法测序得到的武芝2号ITS序列（MG282563.1,649 bp），与GenBank中5个紫芝ITS序列具有高相似度（99.53%～100%），并且与已知4个紫芝菌株或实物标本在灵芝属系统进化树上聚为一个分支，同属一个种群。已知2个紫芝特异性引物短序列（GS1＿22bp、GS2＿22bp）出现在武芝2号ITS序列的119～140 bp正向和588～567 bp反向位置；在武芝2号基因组Scaffold No.49上rDNA中找到4个串联重复的ITS区域，与Sanger法测序得到的单个ITS序列高度一致；在ITS2序列二级结构上，武芝2号与ITS2数据库中紫芝Ganoderma sinense的3个螺旋区结构相同，仅螺旋IV区间夹角不同。【结论】基于ITS和ITS2分子鉴定，确认了武芝2号与已知紫芝G. sinense同属一个种群，在ITS2二级结构螺旋IV区存在夹角差异；此外，验证了2个已知紫芝特异性扩增引物的有效性。

• 单位
  福建农林大学; 福建省农业科学院