广东省2株白喉棒状杆菌的鉴定与分析

作者：李振翠; 刘美真; 方艳梅; 贡梓军; 王旭麟; 陈经雕; 李柏生^*

来源：中华预防医学杂志, 2022, 56(04): 427-432.

• 白喉棒状杆菌
• 全基因组测序
• wgSNP进化树
• 鉴定

目的对广东省2株C. diphtheriae白喉棒状杆菌进行精准鉴定与分析。方法通过API Coryne棒状杆菌生化卡对2010年广州和2020年珠海分离的C. diphtheriae进行生化及质谱鉴定;利用Illumina平台进行测序, CLC软件拼接, JSpeciesWS线上工具进行平均核苷酸同源性识别;BLASTN进行narKGHIJ和tox基因检测, 使用MEGA-X构建wgSNP系统发育进化树。结果 GD-Guangzhou-2010为Belfanti型, GD-Zhuhai-2020为Gravis型。棒状杆菌种间ANI值计算结果显示, GD-Guangzhou-2010与C.belfantii间ANIb=99.61%, GD-Zhuhai-2020与C. diphtheriae间ANIb=97.64%。BLASTN结果显示, GD-Guangzhou-2010硝酸盐还原基因narKGHIJ均为阴性且未携带tox基因, GD-Zhuhai-2020硝酸盐还原基因narKGHIJ均为阳性, 未携带tox基因。C. diphtheriae的wgSNP进化树显示两个主要进化分支, 第一个分支包含所有Mitis型和Gravis型以及GD-Zhuhai-2020, 第二个分支包含所有的C.belfantii、C.diphtheriae subsp.lausannense分离株及GD-Guangzhou-2010。结论广东省成功分离鉴定出两株非产毒性C. diphtheriae, 系统发生树提示GD-Guangzhou-2010和GD-Zhuhai-2020位于两个不同的进化分支。

• 单位
  公共卫生学院; 广东省疾病预防控制中心; 珠海市疾病预防控制中心; 广东药科大学