白菜CRM基因家族的生物信息学分析

作者：朱斌; 王晓双; 罗茜; 胡鑫^*

来源：湖北农业科学, 2021, 60(09): 141-146.

DOI：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2021.09.029

• 白菜
• CRM基因家族
• 生物信息
• 生物胁迫

CRM(Chloroplast RNA splicing and ribosome maturation)蛋白结构域参与调控植物线粒体和叶绿体内包含Ⅱ型内含子基因的剪接。研究利用生物信息学的方法,对白菜(Brassica rapa,AA,2n=20)CRM基因家族的基因数量、保守基序、进化关系、氨基酸等电点以及表达量差异等进行分析。结果表明,白菜CRM基因家族共包含22个基因,可分为3个亚族,分布于白菜除A10外的9条染色体上。CRM蛋白编码基因的长度在657～5 909 bp,蛋白质等电点为4.42～9.89,大多数的蛋白质偏碱性。在表达模式上,不同组织和不同胁迫下白菜CRM基因的表达量存在较大差异,部分CRM基因在叶和茎中的转录表达较活跃;以Flg22和Ps模拟生物胁迫,部分CRM基因的表达量显著下调,CRM基因可能响应植物的生物胁迫。

• 单位
  贵州师范大学; 生命科学学院; 浙江农林大学