2014—2018年,南京博物院对下邳故城进行了考古调查、勘探和发掘。初步探明该城址由大小两个城址组成,存城墙、护城河。大城时代最晚为汉代,小城时代为魏晋—明清时期。经发掘确认,下邳故城面积较大、文化堆积厚、遗迹遗物丰富、文化层时代从汉—明清连续不断,是研究古下邳历史的重要遗存。该城址的发掘对探索江苏地域文明具有重要意义。