乙型肝炎病毒前S1抗原关键表位基因分型及其与全长前S1抗原基因型的相关性

作者：张晓晨; 李玉敏; 李家亿; 康新迪; 何欣悦; 牛俊奇; 温晓玉^*; 刘镇宁^*

来源：中华肝脏病杂志, 2018, 26(05): 371-376.

• 肝炎病毒, 乙型
• 基因分型
• 前S1区
• 表位
• 蛋白序列

目的明确乙型肝炎病毒(HBV)大表面蛋白前S1区(PreS1)两个重要表位在中国乙型肝炎患者群中的基因型分布, 探讨两表位基因型之间及两表位基因型与PreS1全长基因型之间的相关性, 确定能否根据关键表位的多肽序列判断PreS1全长基因型。方法从患者血清中提取HBV DNA进行PCR扩增, 对扩增成功的278例样本进行DNA测序, 并与GenBank中已知的HBV序列比对, 确定HBV大表面蛋白PreS1的两个关键表位(第21～47号氨基酸表位和第94～117号氨基酸表位, 分别简称为P21表位和P94表位)基因型及PreS1全长基因型, 并对3组基因分型结果进行一致性分析。一致性检验采用Kappa分析。结果成功测序232例样本。根据P21表位蛋白序列的分型结果为:C基因型201例, B基因型23例, 基因型不确定8例。根据P94表位蛋白序列的分型结果为:C基因型199例, B基因型25例, 基因型不确定8例。根据PreS1全长序列的分型结果为:C基因型207例, B基因型25例。P21表位基因分型和P94表位基因分型与PreS1全长基因分型结果均高度一致, 分别为96.55%和96.12%(Kappa值分别为0.841, 0.826), 且两表位的基因分型结果也具有很好的一致性(93.10%, Kappa值为0.718)。结论本研究创新性地提出基于关键表位氨基酸序列的基因分型方法, 验证了中国乙型肝炎患者群的HBV基因型以B和C基因型为主, 且HBV PreS1关键保守表位的基因分型结果与全长基因分型结果具有高度一致性(> 96%), 可以采用一个或两个关键保守表位的基因分型代替全长基因分型。

• 单位
  吉林大学