lmbr1基因剪接方式分析

作者：黄艳群; 陈文; 李宁; 邓雪梅; 康相涛

来源：郑州大学学报(医学版), 2005, (01): 20-22.

DOI：10.13705/j.issn.1671-6825.2005.01.009

• c7orf2/lmbr1
• 外显子内含子边界
• 可变剪接 c7orf2/lmbr1
• exon-intron boundary
• alternative splicing

目的:探讨lmbr1基因的剪接方式。方法:采用序列比对blast方法,结合基因常见的GU AG剪切方式,对人和鼠c7orf2 /lmbr1基因的内含子 外显子边界进行分析;将从GenBank筛选到的lmbr1cDNA序列及其预测蛋白与其常见转录产物的序列及预测蛋白序列比较,进行lmbr1基因可变剪接的分析。结果:获得了lmbr1基因各个外显子的边界和大小,表明c7orf2 /lmbr1基因有多种转录体,分别预测编码不同长度的蛋白质,其剪接方式包括转录起始位点的改变、外显子丢失、内含子驻留和polyA位点的改变等。结论:lmbr1有多种可变剪接方式,且在不同物种其同源基因有相似的转录产物。

• 单位
  中国农业大学; 河南农业大学; 农业生物技术国家重点实验室