运输毒品犯罪因行为方式隐蔽、证据碎片化断点化、犯罪分子反侦查意识能力强等因素,使行为人主观明知的直接证据较难获取,证明犯罪有相当难度,但仍然可以通过间接证据搭建证明体系。实践中,基础事实证据不充分、司法人员过于保守运用自由心证是通过间接证据成功定案的重要障碍。对此,应将查清基础事实作为案件办理的基本落脚点,坚持以印证为主导、强化心证作用来认定行为人主观明知。