玉米抗冷相关基因ZmSAMDC克隆及生物信息学分析

作者：金时酉; 刘畅; 焦鹏; 费建博; 马义勇^*; 关淑艳^*

来源：吉林农业大学学报, 2021, 43(06): 651-656.

DOI：10.13327/j.jjlau.2021.5162

• 玉米
• SAMDC
• 克隆
• 生物信息学
• 结构预测

在水稻中同源比对得到玉米的SAMDC基因,并利用生物信息学在线软件,对该基因编码的蛋白质结构及理化性质等进行分析。结果表明:ZmSAMDC为疏水性非跨膜类蛋白,无信号肽结构。ZmSAMDC蛋白分子量大小为43 283.12 D,等电点为4.78,氨基酸数共398个,蛋白质不稳定系数为38.32,预测该蛋白为稳定蛋白。ZmSAMDC蛋白存在44个潜在磷酸化位点,其中23个丝氨酸(Ser)磷酸化位点,12个苏氨酸(Thr)磷酸化位点,9个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点,磷酸化主要集中在苏氨酸、丝氨酸、酪氨酸残基上。ZmSAMDC蛋白的二级结构以α-螺旋、延伸链、无规则卷曲及β-转角组成。ZmSAMDC结构域为SAMdecarbox结构域,亚细胞主要定位在胞外基质上。

• 单位
  吉林农业大学; 生命科学学院