上海地区人类免疫缺陷病毒1型感染者原发耐药基因及亚型分析

作者：刘莉; 马建新; 郑毓芳; 张仁芳; 沈银忠; 李莉; 陈军; 王珍燕; 孙富艳; 卢洪洲

来源：微生物与感染, 2011, (01): 4-10.

DOI：10.3969/j.issn.1673-6184.2011.01.003

• 人类免疫缺陷病毒
• 基因亚型
• 重组体
• 耐药基因突变 Human immunodeficiency virus
• Gene subtype
• Recombinant form
• Mutation in drug resistance gene

本文通过对未经抗病毒治疗患者的人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株进行检测,了解上海地区HIV-1的亚型分布及原发耐药基因变异现状。对118例未经治疗的HIV感染者标本中HIV蛋白酶全长和部分反转录酶基因进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,经DNA测序后,进行系统进化树分析和重组分析,以确定HIV-1基因亚型和重组体,并与斯坦福耐药数据库比对,了解耐药突变位点。使用斯坦福REGAHIV亚型分型工具和美国国立生物技术信息中心(NCBI)HIV亚型分析工具分析,获得118例患者的HIV基因序列,基因分型分别为CRF01_AE重组体57例(48.3%)、B亚型36例(30.5%)、CRF...

• 单位
  复旦大学附属华山医院; 复旦大学