甲型H1N1病毒HA、NA氨基酸序列比较及抗原性表位预测

作者：邹泽红; 张俊艳; 刘兆宇; 刘昌文; 李胜涛; 何颖

来源：中国医学创新, 2013, (19): 1-3.

• H1N1流感病毒
• 抗原表位
• 血凝素
• 神经氨酸酶 Influenza virus A/H1N1
• Antigenic epitope
• Hemagglutinin
• Neuraminidase

目的:比较新型甲型H1N1流感病毒分离株HA、NA氨基酸序列之间的差异,分析HA、NA蛋白可能的抗原性细胞表位。方法:从GenBank中选取28株世界各地的新型甲型H1N1流感病毒分离株并下载各株HA、NA的氨基酸序列;使用ClustalX和MEGA2.0软件对氨基酸序列的进行进化树分析;用Protean软件预测HA、NA蛋白的B细胞表位;用NetMHCⅡ2.2预测T细胞抗原表位。结果:世界范围的毒株之间氨基酸序列相对保守,HA及NA均只有少数位点的变异,HA蛋白氨基酸序列之间较NA蛋白氨基酸序列之间变异较大;预测HA蛋白具有8个B细胞表位和10个T细胞表位;NA蛋白有12个B细胞表位和7个T...

• 单位
  呼吸疾病国家重点实验室; 广州医科大学