2012—2022年广西HIV-1独特重组型毒株近似全长基因序列特征分析

作者：李媛婷; 陈荣凤; 严文霞; 廖艳研; 叶力; 蒋俊俊; 梁丽娟; 黄耀锋; 秦英梅; 黎彦君^*; 梁浩^*

来源：广西医科大学学报, 2023, 40(02): 199-205.

DOI：10.16190/j.cnki.45-1211/r.2023.02.004

• 人类免疫缺陷病毒
• 独特重组型毒株
• 重组特征

目的：研究广西HIV-1独特重组型毒株（URFs）的基因重组特点，为广西HIV-1疫情防控提供科学依据。方法：对1例pol区基因序列初步判断为URF的HIV-1感染者的血液样本进行RNA提取、巢式PCR扩增全长基因并测序，从PubMed等数据库检索2012—2022年发表的有关广西URFs近似全长基因组的文章及对应的序列，构建系统进化树，并进行重组模式、断点分析和耐药突变位点分析。结果：测序获得1例长度约8.9 kb的URF，该URF是以CRF08＿BC为骨架插入CRF01＿AE片段构成的二代重组毒株。将该URF与数据库中检索到的12例广西URFs共同分析，发现广西URFs主要来源于性传播途径感染者和静脉吸毒感染者。所有URFs均包含CRF01＿AE片段，以01＿AE/07＿BC重组比例最高（69.2%,9/13）,1例URF含有主要耐药位点。结论：广西已鉴定的URFs数量较少，以01＿AE/07＿BC重组为主，应加强对URFs的监测和鉴定，以全面了解广西HIV-1重组毒株的特点。

• 单位
  南宁市第四人民医院; 公共卫生学院; 生命科学研究院; 广西医科大学