玉米大斑病菌不同致病小种StBCK1基因生物信息学分析

作者：周树功; 张晓雅; 张运峰^*

来源：西南农业学报, 2020, 33(08): 1691-1695.

DOI：10.16213/j.cnki.scjas.2020.8.014

• 玉米大斑病菌
• StBCK1
• 生物信息学分析

【目的】为探索StBCK1基因功能的重要影响位点。【方法】通过CTAB法提取了玉米大斑病菌4个小种的基因组DNA,克隆StBCK1基因的关键序列,利用DNAMAN、MEGA和NetPhos2.0 Server比对了玉米大斑病菌不同小种间的遗传差异,并分析StBCK1的蛋白质磷酸化位点。【结果】StBCK1的蛋白质激酶结构域位于DNA序列的4155～5016位,肽链的1385～1672位;在DNA序列比对中发现3个SNP位点;1个位点导致氨基酸由亮氨酸转变为苯丙氨酸,2个位点导致丝氨酸突变为异亮氨酸和天冬酰胺突变为异亮氨酸;3个位点差异均与蛋白质磷酸化位点相关。【结论】3个位点的多态性影响了蛋白质结构与功能,进而影响了玉米大斑病菌的致病性差异。

• 单位
  唐山师范学院