隆林牛与郏县红牛线粒体DNA全基因组遗传多样性比较研究

作者：宣泽义; 陈嘉磊; 陈少梅; 易显凤; 文信旺; 肖正中; 汪燕玲; 雷初朝

来源：中国牛业科学, 2022, 48(03): 1-5.

• 隆林牛
• 郏县红牛
• mtDNA全基因组
• 遗传多样性
• 母系起源

[目的]本研究旨在从基因组水平探究隆林牛和郏县红牛的线粒体DNA(mtDNA)全基因组遗传多样性与母系起源，并对2个黄牛品种的mtDNA全基因组遗传多样性进行比较分析。[方法]采用全基因组重测序及生物信息学方法。[结果]在15头隆林牛和28头郏县红牛mtDNA全基因组序列中，共检测到36种单倍型，其中郏县红牛有26种单倍型，隆林牛仅有8种单倍型，2个黄牛品种共享2种单倍型。郏县红牛和隆林牛的平均单倍型多样度(Hd)分别为1.000和0.943,平均核苷酸多样度(Pi)分别为0.0080和0.0053,表明其遗传多样性丰富。构建的系统发育树表明，隆林牛和郏县红牛具有瘤牛和普通牛两个母系支系。[结论]隆林牛以瘤牛起源为主，郏县红牛为普通牛与瘤牛的混合起源，这2个地方黄牛品种具有独特的母系遗传信息，表现出明显的母系遗传差异。

• 单位
  广西壮族自治区畜牧研究所; 西北农林科技大学; 动物科技学院