苹果TCP转录因子家族生物信息学分析

作者：张士刚

来源：山东农业科学, 2014, 46(05): 12-17.

DOI：10.14083/j.issn.1001-4942.2014.05.002

• 苹果
• TCP
• 转录因子
• 全基因组分析

TCP蛋白家族是一类植物特有的转录因子家族,参与多种生理生化过程,具有重要的调控作用。本文利用生物信息学方法对苹果TCP转录因子家族成员、基因分类、基因结构、染色体定位、系统进化关系和结构域序列保守性进行了预测和分析。结果表明,苹果TCP基因家族包含52个成员,分为3类:ClassⅠ、ClassⅡ和ClassⅢ;MdTCP蛋白含有115612个氨基酸,等电点为5.4110.65;除3号染色体外,其余16条染色体均有MdTCP基因分布,其中5号染色体最多,有7个。