基于RNA-Seq的辣木叶转录组研究

作者:张雅玲; 王小安; 潘少霖; 叶新福
来源:福建农业学报, 2017, 32(10): 1111-1117.
DOI:10.19303/j.issn.1008-0384.2017.010.013

摘要

为探讨辣木叶营养价值形成的遗传基础,采用RNA-seq对不同发育时期的辣木叶混合样品进行转录组测序,获得44 056 449个reads,共组装得到75 452条unigene,平均长度为795.69nt,其中有15 824条unigene长度大于1 000nt。采用公共数据库进行同源比对,共有30 847条unigene得到注释。其中,有18 277条unigenes被注释到GO数据库的52个功能组,9 689条unigene在COG数据库中得到注释。有10 130条unigene被富集到129条KEGG途径,包括碳代谢、氨基酸生物合成和氧化磷酸化途径。

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