我国四株埃可病毒6型全基因组序列及重组特征分析

作者：程文隽; 蔡茹^*; 冀天娇^*; 陈雨; 马江涛; 单军; 于秋丽; 张勇; 严冬梅; 杨倩; 宋洋; 路环环; 张珂艺; 许文波

来源：病毒学报, 2021, 37(01): 123-132.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003850

• 埃可病毒6型(ECHO6)
• 全基因组序列
• 基因重组

埃可病毒6型(Echovirus 6,ECHO6)作为肠道病毒B组(Enterovirus B,EV-B)的一员,在临床上常导致无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM)、急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)、手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)等多种疾病。本文挑选四株中国大陆地区不同年份、地区及疾病严重程度的代表毒株进行全基因组测定分析,与GenBank上ECHO6全长代表株及EV-B组原型株比对分析,了解其进化特征,并筛选BLAST结果的EV-B组流行株,探究我国流行的ECHO6与其他血清型的基因重组特征。结果提示,本研究四株ECHO6毒株在非结构蛋白区与EV-B其他血清型均发生重组,其中死亡病例标本重组模式更为复杂,可能与疾病严重程度有关。通过本研究分析,可进一步揭示ECHO6的遗传特征,为肠道病毒血清型研究提供基础数据,对了解其进化变异及临床致病力影响具有重要意义。

• 单位
  中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所; 宁夏疾病预防控制中心; 江苏省疾病预防控制中心; 河北省疾病预防控制中心; 安徽理工大学; 湖南省疾病预防控制中心