EGF对hAMSCs基因表达谱影响及生物信息学分析

作者：庞希宁; 李彩虹; 施萍; 王竟; 刘晓玉; 张涛; 张殿宝; 赵峰

来源：基础医学与临床, 2013, (11): 1391-1397.

DOI：10.16352/j.issn.1001-6325.2013.11.015

• 表皮生长因子
• 人羊膜间充质干细胞
• 基因表达谱
• 测序
• 生物信息学 epidermal growth factor
• human amnion mesenchymal stem cells
• gene expression profile
• sequencing
• bioinformatics

目的探讨表皮生长因子(EGF)对人羊膜间充质干细胞(hAMSCs)基因表达谱影响及分子机制。方法采用基因表达谱测序(Illumina RNA-Seq)技术和生物信息学分析方法,对100 ng/mL EGF干预前后的hAMSCs基因表达测序比对,确定hAMSCs基因表达谱,RT-PCR检测进行验证。结果筛选出差异表达基因104个(FDR≤0.001和|log2Ratio|≥1),其中上调差异表达基因56个,下调差异表达基因48个;GO生物学过程富集分析26个生物学过程具有显著性差异(P≤0.05);KEGG信号通路富集分析细胞因子与细胞因子相互作用信号通路具有显著性差异(Q≤0.05),RT-P...

• 单位
  中国医科大学附属第一医院; 中国医科大学