办学水平提升与专项资金增速放缓是高校面临的两项重要挑战。对高校专项资金进行绩效评价以提升资金效率与效益,并对专项资金进行精细化管理,具有积极的意义。为探究高校专项资金绩效评价与精细化管理,本文运用平衡计分卡法对高校专项资金绩效评价进行研究,构建绩效评价体系,对专项资金进行绩效评价,进而从预算编制、目标导向、效益导向等几个方面提出针对性意见。