摘要
目的 探讨儿童肥大腺样体组织滤泡树突状细胞(follicular dendritic cells, FDCs)的基因表达特征、精细分群、发育路径及转录调控网络。方法 采用单细胞转录组测序技术结合生物信息学分析手段,明确儿童肥大腺样体组织FDCs的基因表达特征及亚群分群信息;通过KEGG、GO、irGSEA等基因功能富集分析方法,阐述不同FDCs亚群生物学功能;利用拟时序分析,探索FDCs细胞亚群间的发育关系;运用SCENIC分析方法描绘不同FDCs亚群的转录调控网络。结果 共获得6个FDCs亚群,功能富集结果显示它们具有不同的功能;拟时序分析结果显示各亚群的发育分化轨迹起始于CXCL14+APOD+FDCs与SLCO2B1+PAPPA+FDCs;转录因子调控网络的分析结果提示FDCs的SCENIC分群与Seurat分群并非完全重合,多组间存在较大比例的交叉。结论 儿童肥大腺样体组织内包含多个FDCs亚群,具有多种功能,存在连续的发育分化关系,部分亚群受到相同的转录因子网络的调控。
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单位上海交通大学医学院附属第六人民医院; 上海交通大学