棉花RAV基因家族的全基因组分析

作者：卢合均; 周忠丽; 陈浩东; 凌键; 刘方; 蔡小彦; 王星星; 王春英; 王玉红; 王坤波

来源：棉花学报, 2014, (06): 471-482.

• RAV基因
• 转录因子
• AP2结构域
• B3结构域
• 基因复制
• 黄萎病 RAV gene
• transcription factor
• AP2 domain
• B3 domain
• gene duplication
• Verticillium dahliae

在二倍体棉花D5基因组(Gossypium raimondii Ulb.)数据库中鉴定出10个RAV基因,分布于4、5、8、9、13号染色体;在二倍体棉花A2基因组(Gossypium arboreum L.)数据库中鉴定出10个RAV基因,与棉花D5基因组的R AV成员的数量和序列具有一一对应的同源关系,推测棉花A、D组的祖先种中可能存在10个RAV基因。对植物R AV蛋白序列做系统发育分析,将R AV成员分为4个组;发现棉花R AV基因可能参与了棉属所特有的基因组多倍化事件的证据。对N CBI中陆地棉(Gssypium hirsutum L.)EST、Unigene数据库做比对统计,得到陆...

• 单位
  中国农业科学院蔬菜花卉研究所; 中国农业科学院棉花研究所; 棉花生物学国家重点实验室; 湖南省棉花科学研究所