CiWRKY17基因克隆与生物信息学分析

作者：白明珠; 万永青; 李国婧; 王瑞刚^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(08): 3561-3569.

DOI：10.13417/j.gab.039.003561

• WRKY
• 基因克隆
• 生物学信息

本研究主要目的是克隆中间锦鸡儿WRKY17转录因子并对其编码蛋白的理化性质及结构特征进行生物学特性分析。首先对CiWRKY17进行基因克隆,其次将PCR扩增后得到的全长连接到克隆载体上,最后利用生物信息学工具分析CiWRKY17等蛋白的生物学特性。结果显示,CiWRKY17基因全长957 bp,编码318个氨基酸残基,此蛋白属于WRKY超家族中IId亚家族(组)的成员,是位于细胞核中的稳定亲水性蛋白,其二级结构主要由无规则卷曲、α-螺旋和β-折叠构成,其中无规则卷曲为二级结构中最主要的结构元件,并且二级结构与三级结构预测结果高度一致。最后得出结论,这8种不同植物中的WRKY17转录因子具有高度相似的结构和特征,因此应均具有与盐胁迫相关的抗性。

• 单位
  内蒙古农业大学