2014-2019年山东省潍坊市流行的肠道病毒A组71型的VP1区基因特征分析

作者：张凤娟; 刘德辉; 王晓倩; 霍锡元; 张作栋; 聂清^*

来源：疾病监测, 2023, 38(10): 1229-1232.

• 肠道病毒A组71型
• VP1
• 系统发育
• 选择性压力

目的 了解2014—2019年山东省潍坊市流行的肠道病毒A组71型（EV71）VP1区基因遗传特征、进化关系及VP1区密码子所处的选择性压力。方法 随机选取2014—2019年潍坊市EV71感染手足口病患者的阳性标本，经人横纹肌肉瘤细胞分离培养后提取病毒总RNA，采用反转录聚合酶链式反应对VP1区基因扩增后进行序列测定，并分析与EV71各基因型代表株的核苷酸及氨基酸的同源性，构建2008年以来我国不同省份EV71及本地EV71 VP1区系统进化树。通过Datamonkey在线服务器采用单似然祖先计数（SLAC）及固定效应可能性模型（FEL）方法对C4a亚型VP1区密码子进行选择性压力分析。结果 共获得的41株本地EV71毒株，均与C4a基因亚型的同源性最高，核苷酸同源性为94.9%～98.2%，氨基酸同源性为98.3%～99.6%。系统进化树显示本地EV71毒株均属C4a基因亚型，形成2个明显的支系，每一分支中既有成簇毒株也有散在分布毒株，并与多地毒株亲缘关系较近。采用SLAC和FEL分别鉴定出136和190个密码子为负向选择性压力位点，不存在正向选择性压力位点。结论 2014—2019年潍坊市流行的EV71毒株属于C4a基因亚型，存在多条传播链，VP1区强烈的负选择压力表明VP1区抗原的稳定性，VP1蛋白的变异不是由宿主免疫系统的选择性压力引起的，这有利于EV71疫苗的应用。

• 单位
  潍坊市疾病预防控制中心; 潍坊市人民医院