硒蛋白基因在人类免疫缺陷病毒感染和母婴传播中的表达水平及预测模型构建

作者：戚燕; 张荣强; 张灵芝; 李晶; 陈雪芹; 付国涛; 李灵兰; 李秀芹^*

来源：中国医学科学院学报, 2023, 45(04): 563-570.

• 硒蛋白基因
• 人类免疫缺陷病毒
• 母婴传播
• Logistic回归
• 列线图

目的 探讨硒蛋白基因在人类免疫缺陷病毒(HIV)感染及其母婴传播中的表达水平，为艾滋病的预防及诊疗提供新的理论依据。方法 在基因表达数据库检索下载数据集GSE4124,样本由HIV阳性组(n=25)和对照组(n=20)构成，其中HIV阳性组包括母婴传播(TR)组(n=11)和非母婴传播(NTR)组(n=14);采用t检验分析4组(HIV阳性组比对照组、NTR组比对照组、TR组比对照组、TR组比NTR组)硒蛋白基因表达水平的差异；随后采用单因素和多因素Logistic回归分析差异表达基因对HIV感染和母婴传播的影响；应用R语言构建列线图预测模型并验证其效能。结果 与对照组比较，HIV阳性组、NTR组、TR组分别有8、5、8个差异表达硒蛋白基因为下调基因；与NTR组比较，TR组有4个差异表达硒蛋白基因为下调基因。单因素Logistic回归分析显示，GPX1、 GPX3、 GPX4、 TXNRD1、TXNRD3、 SEPHS2基因异常高表达对HIV感染均具有影响，而对母婴传播无影响作用。多因素Logistic回归分析显示，TXNRD3基因的异常高表达与是否HIV感染呈正相关(OR=0.032,95%CI=0.002～0.607,P=0.022)。列线图预测模型的预测效能显示，HIV感染者生存时间1、3年的受试者工作特征曲线下面积分别为0.840(95%CI=0.690～1.000)和0.870(95%CI=0.730～1.000)。结论 多个硒蛋白基因差异表达水平下调，参与调控HIV感染和母婴传播过程；其中，TXNRD3基因异常高表达与是否HIV感染呈正相关，为艾滋病防治、诊疗提供了新思路。

• 单位
  公共卫生学院; 陕西中医药大学