基于rpoB基因分析方法鉴定艾伯特埃希菌

作者：赵冰; 黄红; 朱林英; 李彩云; 王闻卿; 崔琪奇; 沈奕峰^*

来源：职业与健康, 2019, 35(12): 1625-1628.

DOI：10.13329/j.cnki.zyyjk.2019.0430

• 艾伯特埃希菌
• 表型
• rpoB基因
• 鉴定

目的探讨一种合理的方法对既往分离到的鉴定为致病性大肠杆菌(EPEC)的菌株进行重新鉴定,发现可能存在的艾伯特埃希菌。方法以2013—2017年上海市浦东地区腹泻监测中分离到的491株EPEC为分析对象,首先用基于表型的方法进行筛检,然后用聚合酶链式反应(PCR)检测毒力基因,并对可疑株rpoB基因进行扩增和测序,获得的序列在genbank数据库中进行匹配,以艾伯特埃希菌参考株以及其他密切相关的大肠埃希菌和志贺菌的rpoB基因序列作为参考序列,使用MEGA8.0的最邻接法构建进化树。结果经筛选,33株生化表型符合艾伯特埃希菌株中,10株clpX、lysP、mdh以及ctdB基因阳性,符合艾伯特埃希菌定义,其rpoB基因序列与艾伯特埃希菌参考菌株的序列高度相似,并与其聚类为一簇,与其他23株菌株以及志贺菌、大肠埃希菌等参考菌株有显著区别。结论表型鉴定方法结合rpoB基因测序分析可用于艾伯特埃希菌的准确鉴定。

• 单位
  复旦大学; 上海市浦东新区疾病预防控制中心