前列腺癌和癌旁组织差异表达基因的筛选和鉴定

作者：刘霞; 高玉兰; 张娜; 倪永梁^*

来源：中华实验外科杂志, 2023, 40(12).

• 前列腺癌
• 差异基因
• YAP信号通路
• p53信号通路

目的探讨前列腺癌和癌旁组织差异表达基因和蛋白的筛选和鉴定。方法选取2019年6月至2022年6月我院收集的10例前列腺癌组织和对应癌旁组织作为研究对象, 采用运用Illumina Hiseq 2500测序平台完成转录组测序, 用定量聚合酶链式反应(PCR)和蛋白质免疫印迹对筛选到的前10位差异表达基因和蛋白进行验证和富集, 对两组样本的检测数据进行统计学对比分析。结果与癌旁组织比较, 前列腺癌组织中312个差异表达基因, 其中上调表达基因201个, 下调表达基因111个。其中上调表达显著性最高的5个基因分别是ASPM、CCNB2、CDC20、CENPF、CEP55, 下调表达显著性最高的5个基因分别是SLC9A9、SDPR、GFRA1、BMP5、SMOC2。生物学过程分析显示这些差异表达蛋白主要在细胞成分形态发生、细胞内受体介导信号通路和葡萄糖代谢发挥作用。分子功能主要包括结构分子生物活性和氨基酸、脂质和糖代谢酶活性。KEGG通路主要聚类在YAP信号通路、p53信号通路、Wnt信号通路、糖酵解通路和RNA代谢通路。癌旁组织ASPM、CCNB2、CDC20、CENPF、CEP55 mRNA表达水平(1.01±0.12、1.02±0.15、1.07±0.14、1.04±0.13、1.07±0.17)明显低于前列腺癌组织(3.01±0.19、2.56±0.22、2.43±0.27、2.15±0.37、1.99±0.26), 差异有统计学意义(t=28.350、17.810、14.170、9.248、9.076, P<0.05)。癌旁组织SLC9A9、SDPR、GFRA1、BMP5和SMOC2 mRNA表达水平(1.01±0.10、1.06±0.08、1.09±0.10、1.05±0.09、1.09±0.09)明显高于前列腺癌组织(0.32±0.11、0.40±0.07、0.58±0.05、0.66±0.06、0.73±0.09), 差异有统计学意义(t=14.310、18.600、14.490、11.560、8.917, P<0.05)。癌旁组织ASPM、CCNB2、CDC20、CENPF、CEP55蛋白相对表达水平(1.33±0.12、1.16±0.10、1.10±0.06、1.21±0.09、1.18±0.08)明显低于前列腺癌组织(3.13±0.18、2.74±0.22、2.27±0.19、2.07±0.12、1.78±0.20), 差异有统计学意义(t=26.780、20.200、18.700、17.810、8.750, P<0.05)。癌旁组织SLC9A9、SDPR、GFRA1、BMP5和SMOC2蛋白相对表达水平(1.42±0.13、1.38±0.10、1.39±0.08、1.52±0.12、1.36±0.14)明显高于前列腺癌组织(0.30±0.05、0.43±0.05、0.57±0.03、0.76±0.09、0.81±0.14), 差异有统计学意义(t=25.390、27.320、31.190、15.710、9.264, P<0.05)。结论前列腺组织表达的基因主要富集于YAP、P53和Wnt信号通路, 这些信号通路可能参与了调控前列腺癌的发生和发展。

• 单位
  山东大学