独立学院产权设计过程中产生了若干问题,如独立学院的名称、投资主体的确立、资产评估与清算的方式、运行模式与机制的构建,以及利益分配等。独立学院产权设计的最佳方式应该是政府、母体学校与"非财政性经费"投入组织或个人共同博弈优化的结果,这种结果既是三方的共赢,也能够有效满足社会、家庭(学生)的高等教育需求。