铁皮石斛亲环蛋白基因DoCyP的克隆及表达分析

作者:付亚娟; 陈霞婷; 乔洁; 王晶; 李文静; 侯晓强*
来源:园艺学报, 2020, 47(03): 581-589.
DOI:10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0357

摘要

采用RT-PCR技术克隆了铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)亲环蛋白基因(DoCyP),其大小为522 bp,编码173个氨基酸。生物信息学预测,DoCyP相对分子质量18.25 kD,理论等电点8.72,含肽脯氨酰顺反异构酶保守结构域,无跨膜结构域,是稳定的亲水性蛋白质。SOPMA预测DoCyP的二级结构主要由无规卷曲和延伸链构成。系统进化树揭示铁皮石斛DoCyP与深圳拟兰CyP聚为一支,亲缘关系较近。qRT-PCR分析表明,DoCyP在铁皮石斛组织中为组成型表达,在根中表达量最高,叶和茎中表达量较低。4℃胁迫12h,DoCyP在铁皮石斛根和茎中表现为上调表达,在叶中下调表达。推测DoCyP参与铁皮石斛对低温胁迫的应答。

  • 单位
    廊坊师范学院; 生命科学学院