针对我国科技期刊管理体制特点、编辑人员结构特点和学者参与办刊的实际情况，本文从科技期刊出版流程(即内容生产和内容传播)出发，对以编辑为主和以学者为主的2种编辑部运营模式进行分析，梳理了编辑和学者在不同模式中的定位与职能，指出各自的优势与不足。提出编专深度结合的科技期刊编辑部运营模式，阐述了执行主编(或副主编)、编辑和学者的职责，分析模式的可行性，介绍典型案例。希望编专深度结合的科技期刊编辑部运营模式能对我国科技期刊的良性发展提供理论支撑。
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