基于全基因组序列的污染事件中椰毒假单胞菌酵米面亚种溯源分析

作者：陈荣桥; 陈汉金; 冼燕萍^*; 侯向昶; 朱文信; 郭燕华; 胡均鹏; 梁明; 刘冬虹; 吴玉銮

来源：食品安全质量检测学报, 2021, 12(09): 3854-3859.

DOI：10.19812/j.cnki.jfsq11-5956/ts.2021.09.063

• 椰毒假单胞菌酵米面亚种
• 湿粉及其原料米
• 全基因组序列
• 进化树
• 溯源

目的溯源分析湿米粉与淀粉制品(统称为"湿粉")及其原料米中分离的椰毒假单胞菌酵米面亚种。方法采用GB/T 4789.29—2003《食品安全国家标准食品卫生微生物学检验椰毒假单胞菌酵米面亚种检验》在14份湿粉及其原料米中分离出34株唐菖蒲伯克霍尔德氏菌并进行菌株全基因组重测序,以BurkholderiagladioliCo14作为参比基因,基于单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)数据构建进化树,分析不同菌株的同源关系。结果来源于相同产地标识的样品的菌株呈现较好聚类;来源于同一生产企业的湿粉和碎米样品的菌株具有高度同源关系。结论提示原料米中椰毒假单胞菌酵米面亚种的基因组序列与产地溯源具有较大相关性,在湿粉生产加工过程中存在椰毒假单胞菌酵米面亚种污染传递的风险。

• 单位
  广州质量监督检测研究院