摘要
目的了解宏基因组测序技术(metagenomic next generation sequencing, mNGS)和传统细菌培养联合荧光定量PCR(qPCR)两种检测方法在儿童中枢神经系统(central nervous system, CNS)感染性疾病诊治方面的指导意义。方法收集2019年4月至2020年1月考虑CNS感染性疾病的55例患儿为观察组, 进行脑脊液mNGS检测, 2018年5月至2019年4月疑似CNS感染并进行了脑脊液常规培养和qPCR检测的51例患儿为对照组。观察组年龄5个月~9岁, 对照组年龄1个月~11岁。对比两组病原检测阳性率和住院时间。结果观察组中24例患儿脑脊液标本的高通量测序结果为阳性, 灵敏度为43.6%, 其中11例(20.0%)检测为细菌, 2例(3.6%)检测为真菌, 9例(16.4%)检测为病毒, 2例(3.6%)检测为分枝杆菌;在总阳性率上高于对照组, 差异有统计学意义(P<0.05)。观察组患儿住院时间为(17.19±13.3)d, 对照组患儿住院时间为(24.90±14.8)d, 差异有统计学意义(t=2.825, P=0.006)。结论 mNGS在脑脊液病原菌检测方面优于传统细菌培养联合qPCR, 可以缩短CNS感染性疾病患儿的住院时间。
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